無事アクティベーションに成功して、Mac Developer Programへの登録が完了したので、早速Gatekeeperへの対応作業を開始

Tools Workflow Guide for Mac: Distributing Outside the Mac App Storeの手順通りに

Xcode 4.3.3を起動

「Window」メニューより、「Organizer」を選択

Organizerウインドウにて、上の「Devices」を選択したら、左のLIBRARYより「Provisioning Profiles」を選択

右下のRefreshボタンをクリック

「Sign in with your Apple ID」ダイアログが表示されるので、ログイン

「No Mac Development Certificate Found」が表示されたら、「Submit Request」ボタンをクリック
何度か表示されるので、その都度、「Submit Request」ボタンをクリック

証明書の取得が完了すると、書き出しますかと言われるので、適当なファイル名と、パスワード（忘れないように）を設定して保存

左のTERMSの自分の名前を選択すると、キーチェーンに格納された証明書が表示されます。

開発中のアプリケーションへの反映

Xcodeでプロジェクトを開いて、PROJECTを選択したら、Build Settings, Allを選択
検索フィールドに「code signing」と入力して検索
「Code Signing Identity」ポップアップメニューより自分のDeveloper ID Application certificateを選択

Runボタンをクリックして実行。キーチェーンのダイアログが表示されたら、常に許可を選択。

ビルドするアプリケーションへの反映

Xcodeにてプロジェクトを開き、「Product」メニューより「Archive」を選択
「Archive」が完了すると、「Organizer」が開くので
Organizerウインドウにて、上の「Archives」を選択したら、リストから反映させるアプリを選択して、右側の「Distribute.」ボタンをクリック

表示されたダイアログにて、「Export Developer ID-signed Application」を選択したら、「Next」ボタンをクリック

次のダイアログにて、Developer IDポップアップメニューより、自分のDeveloper ID名を選択して、「Next」ボタンをクリック

保存場所を指定して、保存。

正しく設定されたかを10.7.4にて検証（10.7.4にはGetekeeperの機能が備わっているとのことなので）
Gatekeeperの機能を有効にする
ターミナルを起動したら
「sudo spctl --master-enable」と入力してリターンキー（管理者パスワードを聞かれたら入力してリターンキー）
「spctl --status」と入力してリターンキー
「assessments enabled」と表示されれば有効になっています。

「sudo spctl -a -v 」と入力（最後に半角スペースがあるのに注意）したら、作成したアプリをドラッグすれば、パスが補完されます。（つまり sudo spctl -a -v アプリのパス となります）
リターンキー（管理者パスワードを聞かれたら入力してリターンキー）で、

アプリ名: accepted
source=Developer ID

と表示されたらOK

問題なかったので、Gatekeeperの機能を無効にします。
「sudo spctl --master-disable」と入力してリターンキー（管理者パスワードを聞かれたら入力してリターンキー）
「spctl --status」と入力してリターンキー
「assessments disabled」と表示されれば無効になっています。

これにて、Gatekeeperへの対応完了（たぶん）